Home Staff Collaborators dr Mateusz Baca

dr Mateusz Baca

peru3

Specjalizacja

Antyczny DNA, genetyka człowieka, genetyka populacji, filogeografia

 

Prace badawcze

 

Zainteresowania naukowe dr. Mateusza Baca koncentrują się wokół dwóch głównych zagadnień. Pierwszym z nich jest historia populacji i organizacja społeczna w kulturach przedkolumbijskich Ameryki Południowej, drugim historie ewolucyjne wybranych gatunków zwierząt w późnym plejstocenie i holocenie. Ze szczególnym zainteresowaniem bada wpływ zmian klimatu, które miały miejsce w przeszłości na dynamikę populacji ssaków. Zagadnienie, poza wymiarem czysto poznawczym, jest też istotne z punktu widzenia przewidywania zmian we współczesnych populacjach zwierząt.

Prace badawcze prowadzi w Laboratorium Paleogenetyki i Genetyki Konserwatorskiej, Centrum Nowych Technologii UW. W badaniach wykorzystuje analizy antycznego DNA, czyli DNA uzyskiwanego z tkanek martwych organizmów, w tym szereg technik pozwalających na ekstrakcję, namnożenie i sekwencjonowanie silnie zdegradowanego materiału genetycznego, który zachował się w szczątkach ludzkich lub zwierzęcych. Do realizacji projektów badawczych stosuje metody z zakresu genetyki sądowej, populacyjnej jak i filogenetyki oraz filogeografii.

Aktualnie wspólnie z dr Martyną Molak z Muzeum i Instytutu Zoologii PAN i dr Danijelą Popović z CeNT UW w konsorcjum pomiędzy MiIZ PAN i WH UW realizuje projekt dotyczący kultury Tiwanaku. Wykorzystując najnowszą technikę wzbogacania ekstraktów DNA poprzez hybrydyzację i wysokoprzepustowe sekwencjonowanie zamierzają uzyskać dane genetyczne o wysokiej rozdzielczości, aby rozwiązać szereg zagadnień związanych z historią tej kultury, w szczególności jakiego pochodzenia były ofiary ludzkie, składane na stanowisku ceremonialnym Akapana.

Jednocześnie kontynuuje prace związane ze ssakami z okresu późnego plejstocenu. We współpracy z Instytutem Systematyki i Ewolucji Zwierząt PAN i Zakładem Paleozoologii Uniwersytetu Wrocławskiego rozpoczyna projekt dotyczący historii ewolucyjnej europejskich populacji dwóch gatunków norników.

 

Mateusz Baca Tompullo2 

 

Zapraszam do współpracy archeologów zainteresowanych przeprowadzeniem analiz genetycznych badanego przez nich materiału. W ramach Laboratorium Paleogenetyki i Genetyki Konserwatorskiej możliwe jest wykonanie szeregu badań takich jak określanie przynależności gatunkowej szczątków zwierzęcych, określania płci i pokrewieństwa osób pochowanych w jednym grobowcu lub stanowisku archeologicznym. Odtworzenie niektórych cech fenotypowych (kolor oczu, kolor włosów).

 

Kontakt

tel. 696027235

mail: This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it

 

Publikacje

Palkopoulou E*, Baca M*, Abramson N.I, Sablin M, Socha P, Nadachowski A, Prost S, Germonpre M, Kosintsev P, Smirnov N.G, Vartanyan S, Ponomarev D, Nystrom J, Nikolskiy P, Jass C.N, Litvinov Y.N, Kalthoff D.C,  Grigoriev S, Fadeeva T, Douka A, Higham T.F.G, Ersmark E, Pitulko V, Pavlova E, Stewart J.R, Weglenski P, Stankovic A, Dalen L. (2016) Synchronous genetic turnovers across Western Eurasia in Late Pleistocene collared lemmings. Global Change Biology. DOI: 10.1111/gcb.13214

 

Krajcarz M, Makowiecki D, Krajcarz M.T, Masłowska A, Baca M, Panagiotopoulou H, Bednarczyk J, Romańska A, Gręzak A, Sudoł M. (2015) On the Trail of the Oldest Domestic Cat in Poland. An Insight from Morphometry, Ancient DNA and Radiocarbon Dating. International Journal of Osteoarchaeology. DOI: 10.1002/oa.2471

Popovic D*, Baca M*, Panagiotopoulou H. (2015). Complete mitochondrial genome sequences of Atlantic sturgeon, Acipenser oxyrinchus oxyrinchus, Gulf sturgeon, A. o. desotoi and European sturgeon A. sturio (Acipenseriformes: Acipenseridae) obtained through next generation sequencing. Mitochondrial DNA. DOI:10.3109/19401736.2015.1038799

 

Baca M* , Molak M*, Sobczyk M, Węgleński P, Stankovic A. (2014). Locals, resettlers, and pilgrims: A genetic portrait of three pre‐Columbian Andean populations. American Journal of Physical Anthropology. 154(3), 402-412.

 

Popović D, Panagiotopoulou H, Baca M, Stefaniak K, Mackiewicz P, Makowiecki D, King T.L, Gruchota J, Weglenski P, Stankovic A. (2014). The history of sturgeon in the Baltic Sea. Journal of Biogeography. 41(8), 1590-1602.

 

Baca M , Mackiewicz P, Stankovic A, Popović D, Stefaniak K, Czarnogórska K, Nadachowski A, Gąsiorowski M, Hercman H, et al. (2014) Ancient DNA and dating of cave bear remains from Niedźwiedzia Cave suggest early appearance of Ursus ingressus in Sudetes. Quaternary International. 339 , 217-223.

 

Panagiotopoulou H, Baca M, Popovic D, Weglenski P, Stankovic A. (2014) A PCR-RFLP based test for distinguishing European and Atlantic sturgeons. Journal of Applied Ichthyology. 30(1), 14-17.

 

Popovic D, Panagiotopoulou H, Kleszcz M, Baca M, Rutkowski R, Hesse T, Weglenski P, Stankovic A. (2013) Restitution of vimba (Vimba vimba, Cyprinidae) in Poland: genetic variability of existing and restored populations. Ichthyological Research. 60(2), 149-158

 

Baca M, Doan K, Sobczyk M, Stankovic A, Weglenski P. (2012) Ancient DNA reveals kinship burial patterns of a pre-Columbian Andean community. BMC Genetics. 13(1):1-11.

 

Baca M, Stankovic A, Stefaniak K, Marciszak A, Hofreiter M, Nadachowski A, Węgleński P, Mackiewicz P. (2012) Genetic analysis of cave bear specimens from Niedźwiedzia Cave, Sudetes, Poland. Palaeontologia Electronica. 15(2):21A,16p

 

Stankovic A, Doan K, Baca M, Mackiewicz P, Gromadka R, Socha P, Ridush B, Weglenski P, Nadachowski A, Stefaniak K. (2011) First ancient DNA sequences of the Late Pleistocene red deer (Cervus elaphus) from the Crimea, Ukraine. Quaternary International. 245(2): 262-267.

Baca M, Molak M. (2008) Research on ancient DNA in the Near East. Bioarchaeology of the Near East. 2:39-61.